Хидэо Кодзима, создатель Metal Gear Solid, рассказал, что в пятой игре серии, которая, напомним, состоит из Ground Zeroes и The Phantom Pain, могут быть определенные сюжетные неточности и расхождения с предыдущими играми линейки. С таким предостережением разработчик выступил в интервью Kotaku. Нестыковки могут возникнуть в силу того, что действие пятой части будет происходить после Metal Gear Solid 3: Snake Eater, но в то же время до событий оригинального Metal Gear Solid.